martes, 9 de marzo de 2010

Preguntas relacionadas con GDT_TS y CASP

Obtener la medida GDT_TS: Parece que para obtener la medida GDT_TS un algoritmo de PEP debe predecir posiciones en el espacio en lugar de distancias entre elementos. En mi caso, que obtengo esta última estructura de datos, ¿cómo puedo obtener dicha medida?

Mismo origen de coordenadas de estructuras: En los datos de estructuras de proteínas obtenidas experimentalmente, ¿se ha usado siempre el mismo origen de coordenadas? Ya que CASP valora los algoritmos mediante la medida GDT_TS, entre otras, y ésta compara posiciones en el espacio entre estructuras real y predicha, habrá que usar el mismo origen de coordenadas.

Valores de GDT_TS: En los rankings de los participantes de CASP de anteriores ediciones aparece como mejor algoritmo el de mayor valor de GDT_TS, ¿no debería ser el de menor valor? No comprendo esos valores tan grandes de GDT_TS.

Tengo que resolver estas preguntas...

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