miércoles, 22 de junio de 2011

Algunas consideraciones para mejorar mi método

Tras una reunión con algunos compañeros del grupo de investigación, se han propuesto algunas posibles mejoras a mi método actual para resolver el problema de PSP.
  1. Probar los métodos de regresión que ofrece el paquete R para realizar predicciones sobre las bases de datos generadas por mi método ASPFgen.
  2. Generar sólo las subsecuencias de longitud 2 para realizar selecciones de atributos y predicciones. Se trata de empezar por lo más sencillo e ir subiendo de nivel (luego subsecuencias de longitud 3, etc).
  3. Afinar más en los valores que se generan para los atributos: no usar medias de PFQ, sino quizás diferencias de valores entre el primer y segundo aminoácido de las subsecuencias de longitud 2.
  4. Siempre tomar conjuntos de proteínas que se encuentren en la misma localización en el ser vivo (para que el entorno físico-químico sea el mismo para todas y pueda éste ser despreciado).

No hay comentarios:

Publicar un comentario