Nuevas Aproximaciones Biológicas (FP y JCC)

Ha pasado bastante tiempo desde la última vez que escribí en este blog, y desde entonces he conversado con varios biólogos más. Puede parecer que mi tesis consiste en hablar con biólogos, pero no es así :-): realizo experimentos, documento lo que voy obteniendo, leo artículos, anoto mis ideas… No obstante, hablar con biólogos me está ayudando bastante a comprender el problema que tengo que resolver.

Por razones de privacidad, trataré de no revelar el nombre de ninguna persona en este blog, no obstante, debo incluir algún código de referencia para dichas personas, que me permita organizar mis fuentes de información, sólo para fines propios de mi investigación.

FP
En primer lugar, desde la última vez que escribí en este blog, hice una entrevista a un químico/biólogo del CNB-CSIC en Madrid el 23 de Noviembre de 2009. Para dicha entrevista redacté en detalle las preguntas que le hice y sus respuestas. Además escribí una serie de reflexiones propias. Se trata de un documento de ocho páginas bien estructurado y es fiel al contenido de la entrevista realizada.

JCC
Posteriormente, el 21 de Enero de 2010 vino a dar una charla un Dr. en Informática con elevados conocimientos y experiencia en Biología. Coincidí con él para charlar y tuve la oportunidad de presentarle mi trabajo actual para conocer su opinión. Voy a describir los puntos principales que traté con él, que en realidad son muy pocos.

Afirma que una misma función puede ser conseguida por dos o más estructuras diferentes. Personalmente pienso que, aunque esto sea así, quizás haya un patrón entre todas las estructuras que consiguen una función. Más allá, me planteo lo que yo llamo la caracterización estructural de una función proteínica, que describiré en otro momento.

Por otra parte, le parece interesante deducir las estructuras de las proteínas gracias al conocimiento de la interacción entre las mismas que intervienen en un mismo proceso biológico. Creo que puede existir cierta complementariedad entre las estructuras que interaccionan entre sí. De todos modos, dada una secuencia problema (para la que no se conoce su estructura) no homóloga a las existentes, ¿cómo se iba a poder saber en qué proceso biológico interviene?